Pengembangan populasi tanaman padi mutan dengan insersi stabil transposon Ds dan seleksinya untuk sifat-sifat terkait dengan respons terhadap kekeringan

Version 1.0

Nugroho, Satya, 2018, "Pengembangan populasi tanaman padi mutan dengan insersi stabil transposon Ds dan seleksinya untuk sifat-sifat terkait dengan respons terhadap kekeringan", https://hdl.handle.net/20.500.12690/RIN/OIODS3, RIN Dataverse, V1

Learn about Data Citation Standards.

Contact Owner

Dataset Metrics

0 Views

0 Downloads

Description

Laju konversi lahan yang cepat dan pemanasan global mengakibatkan berkurangnya produksi padi. Untuk meningkatkan produksi padi, langkah yang harus ditempuh adalah memperluas areal tanam dengan memanfaatkan lahan marjinal yang cenderung kekurangan air. Cekaman kekeringan harus diikuti oleh kemampuan padi untuk berproduksi tinggi, baik di lahan kering maupun lahan persawahan. Tujuan penelitian ini adalah 1) memanfaatkan sumber daya genetika padi untuk meningkatkan produksi beras; 2) memanfaatkan lahan marjinal untuk meningkatkan pendapatan petani; 3) memanfaatkan perpustakaan mutan padi untuk pencarian gen padi terkait sifat ketahanan terhadap rendaman, naungan, serta cekaman abiotik dan biotik; 4) kemungkinan menerapkan pengetahuan tentang konversi fungsi gen pembawa sifat pada tanaman yang berbeda. Metode reverse genetics melalui mutagenesis dengan T-DNA dan transposon Ac/Ds digunakan untuk isolasi dan karakterisasi gen-gen yang bertanggung jawab pada kekeringan. Pada penelitian ini digunakan mutan tanaman padi yang berisi insersi transposon Ds pembawa gen trap. Hasil penelitian menunjukkan bahwa transformasi padi untuk memasukkan elemen Ac dan Ds sudah selesai dilakukan dan benih sudah dipanen. Sampai saat ini telah diperoleh tanaman pembawa Ds, sebagian merupakan sister-lines, sebanyak 1.576 tanaman. Jumlah tanaman independen diperkirakan 523 tanaman dan 240 tanaman sudah dikarakterisasi pola insersinya. Dari tanaman yang sudah diisolasi DNA-nya, sebanyak 62 sudah diketahui membawa satu salinan T-DNA dan 40 galur tanaman single copy tersebut sudah disilangkan dengan tanaman pembawa Ac untuk mendapatkan mutagenic lines (F1). Seleksi tanaman F2 dengan insersi Ds telah menghasilkan 1.821 kandidat tanaman stabil. Benih-benih hasil perbanyakan diseleksi untuk perubahan sifat terkait dengan respons terhadap kekeringan menggunakan metode polyethylene glycol (PEG) dan polyvinyl chloride (PVC). Beberapa mutan menarik responsif kekeringan, baik lebih toleran maupun lebih sensitif, sudah teridentifikasi melalui metode PEG. Dengan metode TAIL-PCR daerah insersi 2 mutan toleran PEG sudah dipetakan. Dengan bioinformatikan, gen penting yang diduga berperan dalam mutasi toleran PEG sudah diidentifikasi dan diklon untuk dipelajari fungsinya. Percepatan diperolehnya diploid mutan melalui kultur antera telah menghasilkan 35 genotipe yang double haploid. (CA) (2010)

Subject

Agricultural Sciences


There are no files in this dataset.

Citation Metadata

Dataset Persistent ID	hdl:20.500.12690/RIN/OIODS3
Publication Date	2018-02-05
Title	Pengembangan populasi tanaman padi mutan dengan insersi stabil transposon Ds dan seleksinya untuk sifat-sifat terkait dengan respons terhadap kekeringan
Author	Nugroho, Satya (Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI)
Contact	Use email button above to contact. Nugroho, Satya (Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI)
Description	Laju konversi lahan yang cepat dan pemanasan global mengakibatkan berkurangnya produksi padi. Untuk meningkatkan produksi padi, langkah yang harus ditempuh adalah memperluas areal tanam dengan memanfaatkan lahan marjinal yang cenderung kekurangan air. Cekaman kekeringan harus diikuti oleh kemampuan padi untuk berproduksi tinggi, baik di lahan kering maupun lahan persawahan. Tujuan penelitian ini adalah 1) memanfaatkan sumber daya genetika padi untuk meningkatkan produksi beras; 2) memanfaatkan lahan marjinal untuk meningkatkan pendapatan petani; 3) memanfaatkan perpustakaan mutan padi untuk pencarian gen padi terkait sifat ketahanan terhadap rendaman, naungan, serta cekaman abiotik dan biotik; 4) kemungkinan menerapkan pengetahuan tentang konversi fungsi gen pembawa sifat pada tanaman yang berbeda. Metode reverse genetics melalui mutagenesis dengan T-DNA dan transposon Ac/Ds digunakan untuk isolasi dan karakterisasi gen-gen yang bertanggung jawab pada kekeringan. Pada penelitian ini digunakan mutan tanaman padi yang berisi insersi transposon Ds pembawa gen trap. Hasil penelitian menunjukkan bahwa transformasi padi untuk memasukkan elemen Ac dan Ds sudah selesai dilakukan dan benih sudah dipanen. Sampai saat ini telah diperoleh tanaman pembawa Ds, sebagian merupakan sister-lines, sebanyak 1.576 tanaman. Jumlah tanaman independen diperkirakan 523 tanaman dan 240 tanaman sudah dikarakterisasi pola insersinya. Dari tanaman yang sudah diisolasi DNA-nya, sebanyak 62 sudah diketahui membawa satu salinan T-DNA dan 40 galur tanaman single copy tersebut sudah disilangkan dengan tanaman pembawa Ac untuk mendapatkan mutagenic lines (F1). Seleksi tanaman F2 dengan insersi Ds telah menghasilkan 1.821 kandidat tanaman stabil. Benih-benih hasil perbanyakan diseleksi untuk perubahan sifat terkait dengan respons terhadap kekeringan menggunakan metode polyethylene glycol (PEG) dan polyvinyl chloride (PVC). Beberapa mutan menarik responsif kekeringan, baik lebih toleran maupun lebih sensitif, sudah teridentifikasi melalui metode PEG. Dengan metode TAIL-PCR daerah insersi 2 mutan toleran PEG sudah dipetakan. Dengan bioinformatikan, gen penting yang diduga berperan dalam mutasi toleran PEG sudah diidentifikasi dan diklon untuk dipelajari fungsinya. Percepatan diperolehnya diploid mutan melalui kultur antera telah menghasilkan 35 genotipe yang double haploid. (CA) (2010)
Subject	Agricultural Sciences
Depositor	Fadilla, Eriza Ayu
Deposit Date	2018-02-01
Related Datasets	Publikas Developing and phenotypic screening of Ds transposon and activation-tag insertional mutant rice population drought tolerant related screening. Nugroho, Satya; Zannati, Anky; Situmorang, Apriadi Annales Bogoriensis Development of a local drought tolerant rice mutant population carrying activation-tag by immature embryo transformation. Erdayani, Eva; Windiastri, Vincentia Esti; Nugroho, Satya Proceeding International Biotechnology Conference, Padang, Agu. 2009 Development of dauble hiploid lines based on the Ds stable mutant lines. Ambarwati, A. Dinar; Apriani, Aniversari; Nugroho, Satya Gene flow from cultivated to weedy and wild rice. Estiati, Amy; Nugroho, Satya Annales Biogorienses, 13(1), 2009, 39-47 Genetic improvement of rice under biotic and abiotic stresess. Nugroho, Satya KIPNAS X, LIPI, Jakarta, 8-10 Nov. 2011 Identification of a protein kinase like coding sequence which may relate to PEG tolerant phenotype Identification of drought tolerant related insertional mutant rice lines using PEG 6000 Nugroho, Satya; Windiastri, Vincentia Esti; Dwi Widyajayantie; Pantouw, Carla Frieda Annales Bogorienses, 13(1), 2009, 31-37 Identification of insertional mutation on rice mutant library containing Ac/Ds transposon by tail-PCR. Erdayani, Eva; Mushofa, Ulfah; Nugroho, Satya Seminar Nasional Sains dan Teknologi IV: peran strategis sains dan teknologi dalam membangun karakter bangsa, Universitas Negeri Lampung, Bandar Lampung, 29-30 Nov. 2011 Identifikasi alur-galur padi mutan insersi toleran dan sensitif cekaman salinitas berdasarkan karakter multivariat pertumbuhan dan biokimia pada fase vegetatif Situmorang, Apriadi; Zannati, Anky; Dwi Widyajayantie; Nugroho, Satya Jurnal Berita Biologi Insertion of activation tag into Batutegi and Kasalath rice cultivar. Windiastri, Vincentia Esti; Erdayani, Eva; Nugroho, Satya Proceeding International Conference on Biological Science, Yogyakarta, Otc. 2009 Insertional mutagenesis approach to isolate drought and salinity stress tolerant genes in rice. Nugroho, Satya Regional Seminar on Advances in Tropical Genomics: conservation and sustainable, IPB, Bogor, 20 Des. 2011 Marker assisted screening for the development of stable Ds insertional mutant population activation-tag for gene discovery. Nugroho, Satya; Dwi Astuti; Zannati, Anky; Windiastri, Vincentia Esti; Pantouw, Carlos Frieda; Sri Indrayani Pengujian toleransi kekeringan pada padi mutan kultivar Nipponbare menggunakan polyethylene glycol (PEG) 6000. Pantouw, Carla Frieda; Windiastri, Vincentia Esti; Nugroho, Satya Seminar Nasional Sains dan Teknologi IV: peran strategi sains dan teknologi dalam membangun karakter bangsa, Universitas Negeri Lampung, Bandar Lampung, 29-30 Nov. 2011 Phenotypic screening of Ds and activation-tag insertion lines at generative stage reveals drought tolerant and sensitive related phenotypes. Nugroho, Satya; Situmorang, Apriadi; Sri Indrayani Seleksi genotipe padi mutan insersi toleran cekaman salinitas berdasarkan karakter pertumbuhan dan biokimia Situmorang, Apriadi; Zannati, Anky; Dwi Widyajayantie; Nugroho, Satya Jurnal Agronomi Indonesia, 38(1), 8-14 Upaya pengembangan populasi padi mutan dengan mutasi insersi transposon As/Ds pembawa gene-trap untuk pencarian gen-gen penting dari padi. Nugroho, Satya; Sri Mulyaningsih, Enung; Dwi Astuti; Pantonio, Carla Frieda Seminar Nasional Agronomi, Universitas Padjadjaran, Bandung, 2007

Waiver

Our Community Norms as well as good scientific practices expect that proper credit is given via citation. Please use the data citation above, generated by the Dataverse.

CC0 - "Public Domain Dedication" Creative Commons CC0 1.0 Public Domain Dedication icon

Guestbook

No guestbook is assigned to this dataset, you will not be prompted to provide any information on file download.

Dataset	Summary	Contributors	Published
No records found.

Edit File

This file has already been deleted (or replaced) in the current version. It may not be edited.

Restrict Files and Add Dataset Terms of Access

Restricting limits access to published files. You can add or edit Terms of Access for the dataset, and allow people to Request Access to restricted files.

Terms of Access

Request Access

Enable access request

Delete Files

The file will be deleted after you click on the Delete button.

Files will not be removed from previously published versions of the dataset.

Select File(s)

Please select one or more files.

Share Dataset

Share this dataset on your favorite social media networks.

Dataset Citations

Citations for this dataset are retrieved from Crossref via DataCite using Make Data Count standards. For more information about dataset metrics, please refer to the User Guide.

Sorry, no citations were found.

Restricted Files Selected

The restricted file(s) selected may not be downloaded because you have not been granted access.

Restricted Files Selected

The restricted file(s) selected may not be downloaded because you have not been granted access.

Click Continue to download the files you have access to download.

Restricted Files Selected

The restricted file(s) selected may not be downloaded because you have not been granted access.

Click Continue to download the files you have access to download.

Delete Dataset

Are you sure you want to delete this dataset and all of its files? You cannot undelete this dataset.

Delete Draft Version

Are you sure you want to delete this draft version? Files will be reverted to the most recently published version. You cannot undelete this draft.

Unpublished Dataset Private URL

Private URL can only be used with unpublished versions of datasets.

Unpublished Dataset Private URL

Are you sure you want to disable the Private URL? If you have shared the Private URL with others they will no longer be able to use it to access your unpublished dataset.

Delete Files

The file(s) will be deleted after you click on the Delete button.

Files will not be removed from previously published versions of the dataset.

Compute

This dataset contains restricted files you may not compute on because you have not been granted access.

Deaccession Dataset

Are you sure you want to deaccession? The selected version(s) will no longer be viewable by the public.

Deaccession Dataset

Are you sure you want to deaccession this dataset? It will no longer be viewable by the public.

Version Differences Details

Please select two versions to view the differences.

Version Differences Details

Version:
Last Updated:

Select File(s)

Please select a file or files to be downloaded.

Select File(s)

Please select a file or files for access request.

Edit Tags

Select existing file tags or create new tags to describe your files. Each file can have more than one tag.

Request Access

You need to Sign Up or Log In to request access to this file.

???file.mapData.unpublished.header???

???file.mapData.unpublished.message???

Dataset Terms

Please confirm and/or complete the information needed below in order to continue.

Preview Guestbook

Upon downloading files the guestbook asks for the following information.

Guestbook Name

Collected Data

Account Information

Package File Download

Use the Download URL in a Wget command or a download manager to download this package file. Download via web browser is not recommended. User Guide - Downloading a Dataverse Package via URL

Download URL

https://data.brin.go.id/api/access/datafile/

Request Access

Please confirm and/or complete the information needed below in order to request access to files in this dataset.

Compute Batch

Clear Batch

Dataset	Dataset Persistent ID

Compute Batch

Submit for Review

You will not be able to make changes to this dataset while it is in review.

Publish Dataset

Are you sure you want to republish this dataset?

Select if this is a minor or major version update.

Minor Release (1.1)

Major Release (2.0)

Publish Dataset

This dataset cannot be published until Riset Kompetitif LIPI Dataverse is published by its administrator.

Publish Dataset

This dataset cannot be published until Riset Kompetitif LIPI Dataverse and RIN Dataverse are published.

Return to Author

Return this dataset to contributor for modification.